财务报表审计的目标是注册会计师通过执行审计工作，对财务报表是否按照规定的标准编制发表审计意见。规定的标准通常是企业会计准则和相关会计制度。当然，对按照计税基础、收付实现制基础或监管机构的报告要求编制的财务报表，注册会计师进行审计也较普遍。财务报表通常包括包括资产负债表、利润表、现金流量表、所有者权益（或股东权益）变动表以及财务报表附注。

    对财务报表有关内容的审计是财务报表审计的核心，即对财务报表中有关数据进行审查分析，验证报表中的数据是否真实正确地反映企业的财务状况、经营成果和现金流动，并进一步观察企业经营活动的合规性、合法性和有效性。由于各种财务报表的性质不同，反映的内容不同，审计人员所审计的内容和方法上也不尽相同。如资产负债表是静态报表，反映某一时点的财务状况，它的资料来源主要来自资产、负债和资本等账户。这类账户属于实账户，既有余额可供核算，又有实物可供盘点，还可以经过调查分析取证以及进行平衡分析、结构分析等，以证实报表数据的真实性;但损益表却不同，其性质属于动态报表，反映的是某一时期的经营过程和结果，其资料来源于收入、成本费用等账户，一般无余额，也无实物供盘点，往往需要通过计算、摊销、分配才能得出其报表项目数所以对它们的审计应采用不同的方法，以获取审计证据，取得审计成果。